Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms