Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM23P36406 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms