Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5DP30049 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms