Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPINB3P29508 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms