Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms