Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCD3P28288 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCD3P28288 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms