Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms