Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B1P20020 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms