Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A1P19634 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms