Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms