Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2P10911 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2P10911 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2P10911 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2P10911 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2P10911 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2P10911 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2P10911 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2P10911 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2P10911 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2P10911 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms