Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN3P07498 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms