Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms