Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFNA4P05014 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms