Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE8BO95263 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms