Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD4O95243 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD4O95243 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD4O95243 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD4O95243 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD4O95243 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD4O95243 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms