Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSO75390 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSO75390 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSO75390 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSO75390 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms