Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms