Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms