Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNSO60931 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNSO60931 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNSO60931 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNSO60931 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNSO60931 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNSO60931 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNSO60931 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNSO60931 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNSO60931 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNSO60931 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNSO60931 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNSO60931 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNSO60931 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms