Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms