Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF208O43345 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF208O43345 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms