Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNMO15061 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNMO15061 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNMO15061 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNMO15061 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNMO15061 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNMO15061 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNMO15061 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNMO15061 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNMO15061 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms