Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-25■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PCSK7-211ENST00000532301 549 ntTSL 418.79■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-215ENST00000529311 529 ntTSL 418.79■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-206ENST00000525879 939 ntTSL 318.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-213ENST00000528914 589 ntTSL 418.34■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FANCG-202ENST00000425676 2108 ntTSL 1 (best)18.26■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PCSK7-209ENST00000530269 583 ntTSL 318.16■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-252ENST00000556329 609 ntTSL 417.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-49■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-211ENST00000482941 707 ntTSL 317.52■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 217.19■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-266ENST00000557198 583 ntTSL 217.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-270ENST00000557318 515 ntTSL 217.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 DIABLO-216ENST00000639973 278 nt16.88■□□□□ 0.294e-14■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-14■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TRAPPC3-207ENST00000497251 715 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-209ENST00000527262 3027 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-205ENST00000450073 563 ntTSL 516.31■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-207ENST00000474534 631 ntTSL 316.12■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FANCG-205ENST00000462124 654 ntTSL 516.04■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-218ENST00000531537 578 ntTSL 415.93■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 GDAP2-206ENST00000494224 730 ntTSL 315.87■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-222ENST00000533665 935 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-273ENST00000557616 579 ntTSL 515.47■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-208ENST00000590480 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-205ENST00000547564 558 ntTSL 415.38■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IFRD2-208ENST00000468737 606 ntTSL 415.37■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-209ENST00000477088 569 ntTSL 415.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IAH1-213ENST00000495797 478 ntTSL 314.99□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IFRD2-212ENST00000484043 614 ntTSL 414.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FANCG-203ENST00000448890 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.41□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-257ENST00000556688 583 ntTSL 514.32□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-204ENST00000445183 3598 ntTSL 214.14□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-260ENST00000556974 1012 ntTSL 514.05□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-203ENST00000439290 4345 ntTSL 214.02□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-232ENST00000554419 583 ntTSL 314□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-259ENST00000556924 603 ntTSL 413.97□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-231ENST00000554415 554 ntTSL 413.88□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-223ENST00000553867 848 ntTSL 513.88□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 CGNL1-203ENST00000559194 577 ntTSL 413.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-265ENST00000557182 559 ntTSL 413.75□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MRPL13-202ENST00000518696 1418 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.33e-14■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MRPL13-203ENST00000518918 633 ntTSL 213□□□□□ -0.333e-14■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IAH1-208ENST00000489468 792 ntTSL 512.8□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-208ENST00000548403 396 ntTSL 512.45□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-210ENST00000397856 1309 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-214ENST00000553442 639 ntTSL 511.7□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-248ENST00000555767 560 ntTSL 411.62□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-221ENST00000532660 545 ntTSL 411.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-240ENST00000555026 1162 ntTSL 511.29□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-206ENST00000586149 258 ntTSL 511.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 AC020907.2-201ENST00000586871 588 ntTSL 411.04□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KLF15-202ENST00000509675 547 ntTSL 410.95□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ECSIT-204ENST00000585318 993 ntTSL 510.77□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-211ENST00000552521 3012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-250ENST00000556008 1051 ntTSL 510.21□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-255ENST00000556457 635 ntTSL 510.2□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-207ENST00000433714 3705 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-249ENST00000555869 871 ntTSL 59.96□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ELOB-204ENST00000494946 472 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-49■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-203ENST00000546662 925 ntTSL 59.41□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IAH1-212ENST00000495494 758 ntTSL 39.07□□□□□ -0.965e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-234ENST00000554483 561 ntTSL 49.06□□□□□ -0.965e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BBS9-210ENST00000465037 535 ntTSL 48.94□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-224ENST00000553900 576 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TCEAL4-207ENST00000469586 566 ntTSL 28.64□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 34.5
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