Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BQV1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BQV1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BQV1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BQV1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BQV1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BQV1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BQV1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms