Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms