Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E9PBE3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E9PBE3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E9PBE3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E9PBE3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E9PBE3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms