Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms