Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms