Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms