Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms