Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
V9GY48 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
V9GY48 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
V9GY48 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
V9GY48 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
V9GY48 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
V9GY48 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
V9GY48 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
V9GY48 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GY48 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GY48 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GY48 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GY48 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GY48 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GY48 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GY48 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms