Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX9Q9Y5X1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX9Q9Y5X1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms