Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms