Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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