Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LEMD3Q9Y2U8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms