Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms