Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms