Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX41Q9UJV9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX41Q9UJV9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms