Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX25Q9UHL0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms