Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1L1Q9UHC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms