Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms