Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.35
CCDC180Q9P1Z9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CCDC180Q9P1Z9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms