Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTEL1Q9NZ71 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTEL1Q9NZ71 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms