Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK12Q9NYV4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms