Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL28Q9NXS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms