Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN6Q9NWW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms