Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms