Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT82Q9NSB4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms