Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms